1.入库成本调整单和出库成本调整单在系统中没有本质的区别，入库成本调整单是增加库存金额的单据，出库成本调整单是减少库存金额的单据，但也可以把入库成本调整单做成减少库存的单据，比如把调整金额录为负数，出库成本调整单也可以这样应用，主要区别在于出库成本调整单有出库调整类型的区别，这个区别就会体现在生成凭证上。
2.出库成本调整单生成凭证时需区分单据调整类型，若单据调整类型为生产领料单，则调整科目应为生产成本的会计科目；若是销售出库单则调整科目应为主营业务成本的会计科目，若是其他出库单则调整科目为其他业务支出等等；凭证分录如下：借： 生产成本（主营业务成本、其他业务支出）贷： 库存商品（存货科目）而入库成本调整单则无法上述这种方式区分，凭证分录与上述分录相反。
